Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SS18Q15532 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SS18Q15532 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms