Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms