Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms