Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
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