Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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