Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms