Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
R3HDM1Q15032 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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