Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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