Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SQLEQ14534 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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