Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNIQ14094 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNIQ14094 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNIQ14094 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNIQ14094 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNIQ14094 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNIQ14094 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms