Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TUBB2AQ13885 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2AQ13885 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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