Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PMS2P11Q13670 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PMS2P11Q13670 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P11Q13670 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P11Q13670 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P11Q13670 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P11Q13670 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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