Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF1Q13351 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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