Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEMA3BQ13214 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms