Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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