Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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