Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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