Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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