Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms