Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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