Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GTF3C1Q12789 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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GTF3C1Q12789 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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GTF3C1Q12789 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3C1Q12789 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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GTF3C1Q12789 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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