Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms