Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM27E3Q08E93 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms