Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms