Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN11Q06124 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms