Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPCQ01831 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPCQ01831 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XPCQ01831 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XPCQ01831 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPCQ01831 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPCQ01831 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms