Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms