Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms