Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms