Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB1P82279 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB1P82279 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB1P82279 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB1P82279 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB1P82279 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB1P82279 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms