Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HBBP68871 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HBBP68871 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HBBP68871 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HBBP68871 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HBBP68871 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HBBP68871 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HBBP68871 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HBBP68871 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HBBP68871 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HBBP68871 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HBBP68871 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms