Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms