Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF3P61204 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF3P61204 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF3P61204 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms