Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP9P55211 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms