Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSBP53539 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSBP53539 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOSBP53539 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms