Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEK4P51957 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK4P51957 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms