Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERFP50548 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERFP50548 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERFP50548 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms