Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBP2P50120 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBP2P50120 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBP2P50120 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBP2P50120 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms