Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF6P49848 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF6P49848 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms