Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms