Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms