Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms