Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP214P35658 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP214P35658 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP214P35658 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP214P35658 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP214P35658 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP214P35658 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP214P35658 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP214P35658 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms