Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms