Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RCVRNP35243 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms