Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC1P35052 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPC1P35052 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms