Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA5P31644 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms