Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms