Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRBP28702 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRBP28702 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRBP28702 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRBP28702 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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