Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCAP28676 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCAP28676 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCAP28676 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCAP28676 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCAP28676 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCAP28676 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCAP28676 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCAP28676 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms